至今，威尼斯德国商馆成立的确切日期仍然是一个谜。其最早记录可以追溯至1225年——当时，人们在里亚托桥旁边的大运河附近发现了一座名为Fondaco（源自阿拉伯语单词fundùq）的建筑，被德国商人用于贸易和住宿。

1月27至28日当晚，第一代德国商馆被一场大火烧毁。 威尼斯共和国下令尽快重建这座建筑。

德国商馆的重建项目由Giorgione和Tiziano负责装饰，仅用了3年时间，已变身成如今的形态。8月1日，商人回到此地重新开展商业活动，其中包括以金属等原材料换取丝绸、香料等贵重物品。

威尼斯共和国的垮台和拿破仑的到来，迫使德国商人彻底放弃进入严重衰落的德国商馆。

该建筑被邮电管理局收购：德国商馆从此成为威尼斯中央邮局的总部。

由邮局下令进行的德国商馆重大修复工程历时数年。由于大量使用钢筋混凝土，该建筑的面貌发生了颇为显著的变化。

德国商馆被售予Edizione Property地产公司。

荷兰建筑师Rem Koolhaas和OMA工作室开始对德国商馆 进行翻修。由Edizione Property主理进行的修复工程亦持续至2016年。

10月1日，威尼斯德国商馆作为DFS首家欧洲店铺向公众开放。